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sgRNA序列设计

 产品介绍


CRISPR技术潜在脱靶效率较TALENZFN等其它基因编辑工具较高,因此关键是设计特异性sgRNA序列。CRISPR技术直至去年才迎来技术应用的爆发期,因此其生物信息学相关软件开发应用一直滞后,这阻碍了整个技术应用领域的快速发展。

目前sgRNA的在线设计网站有:

1.Zhangfeng labhttp://crispr.mit.edu/;

2. Jack Lin's lab CRISPR/Cas9 gRNA finder:http://spot.colorado.edu/~slin/cas9.html;

3. Boutros lab: http://www.e-crisp.org/E-CRISP/; 

4. Zinc Finger Consortium:http://zifit.partners.org/ZiFiT/ChoiceMenu.aspx等网站。

这类网站虽然在一定程度上满足了部分研究者的需要,但仍然存在很多不足和缺陷。例如MIT等网站等待分析结果需要数日,E-CRISP网站的分析结果不提供具体的脱靶数据,ZIFI网站可供选择物种十分有限,jack Lin的网站则几乎要靠自己一个一个收集脱靶信息。上述国外网站物种信息不完整,网络不稳定,无法登录,严重影响科研工作者的工作效率。

这些问题给设计者带来了一定困难,鉴于此碧基Cas9及时推出了本地化运行sgRNA序列设计服务。当日提交设计订单,2-3个工作日给出sgRNA设计结果,不限物种。碧基Cas9提供的分析报告有详细的off-target数据,客户可以根据要求定制,从而自主选择靶点,提高科研工作效率!

       碧基Cas9具有丰富的sgRNA设计经验,提供的序列经过blast,优选脱靶效应最低的序列提交给客户。


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BioGene Cas9 Inc.

Add:  Block D,Erlang High-Tech pioneering zone,Jiulongpo District,Chongqing,P.R.China.  404000

Website: www.bg-cas9.com    

E-mail: bgcas9@163.com

Tel: 400-657-0168, 86-023-65316016/65316556  

Fax: 86-023-65316556